L’ontologie E-Phy, une base de connaissances pour le catalogue des produits phytopharmaceutiques autorisés en agriculture en France
Résumé
The development of semantic resources (ontologies, vocabularies, knowledge graphs, etc.) is a key activity to facilitate data integration and interoperability in agriculture. Often, catalogs or official reference lists do not respect the FAIR principles, and do not exist in an RDF format, as in our case, in agriculture, the E-Phy catalog, produced by ANSES, which contains all the plant protection products (phytosanitary) and their uses, fertilizers and growing media authorized in France. In this work, we detail our approach to formalize the E-Phy catalog in the form of an OWL knowledge base consisting of an ontological model, instances and alignments to other ontologies. We show the various issues encountered in this process, and the limitations of the current model, which is still backward compatible with the original database. We also highlight, with a few SPARQL queries, the added value of the E-Phy ontology’s semantics and alignments with queries impossible on the original data.
Le développement de ressources sémantiques (ontologies, vocabulaires, graphes de connaissances, etc.) est une activité clé pour faciliter l’intégration et l’interopérabilité des données en agriculture. Bien souvent, les catalogues ou les référentiels officiels ne sont pas du tout “FAIR,” et n’existent pas dans un format RDF, comme dans notre cas, en agriculture, le catalogue E-Phy, produit par l’ANSES, qui contient l’ensemble des produits phytopharmaceutiques et de leurs usages, des matières fertilisantes et des supports de culture autorisés en France. Dans ce travail, nous détaillons notre démarche pour formaliser le catalogue E-Phy sous forme d’une base de connaissances OWL constituée d’un modèle ontologique, de ses instances et d’alignements vers d’autres ontologies. Nous montrons les points difficiles rencontrés dans ce processus, et les limites de la modélisation actuelle restée rétro-compatible avec la base de données d’origine. Nous illustrons également la valeur ajoutée de l’ontologie E-Phy via des requêtes SPARQL qui valorisent la sémantique et les alignements et permettent des interrogations impossibles sur les données d’origine.
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